《消化系统影像学诊断手册》分五篇，第一至第四篇每篇分为三章（空腔脏器、实质脏器、腹膜及其结构）。第一篇影像学征象与相关疾病：近200个征象，每一征象涉及10余种疾病，按常见、少见或罕见分别介绍。第二篇影像学诊断的相关临床知识：近100个条目，包括常见疾病的病因、分类、分型、分期、特征等。第三篇影像学诊断的相关综合征：共搜集消化系统综合征130余种，每种包括中英文名称、命名（原创人名、年代、演变）、曾用名、基础知识、临床要点、影像表现、鉴别诊断、推荐文献。第四篇消化系统疾病相关的征：共搜集消化系统疾病相关的“征”270余种，每种包括命名、病理基础、影像表现、鉴别诊断、推荐文献，并附有影像学图片。第五篇影像诊断的相关检查程序：包括影像学诊断检查方法、临床症状相关影像学检查程序、消化系统疾病影像学检查程序。