《闽南与台湾地方文献目录(套装共2册)》分为上编“闽南与台湾研究著作”和下编“闽南与台湾研究论文”两个部分。闽南与台湾研究著作包括社会与政治、文化、经济、历史与地理、科技著作等部分，收录自1820年以来大陆与台港澳及海外出版的有关闽南与台湾的地方文献，以纸质文献为主，兼收其他载体的文献。闽南与台湾研究论文涵盖海峡两岸的学术期刊与学位论文，划分为若干部分。大陆期刊论文部分收录自1954年以来大陆出版的期刊论文，台湾期刊论文部分收录自1971年以来台湾出版的期刊论文，大陆学位论文部分收录自1998年以来大陆出版的博士、硕士学位论文，台湾学位论文部分收录自1993年以来台湾出版的博硕士学位论文。由于不少地方文献属于非正式出版物，较不规范，其中一些文献未标明著者、出版者、出版时间、页数等项，因此书中某些题录出现缺项现象（一般用“不详”表示），请予谅解。