《高等学校"十二五"规划教材•市政与环境工程系列丛书:环境分子生物学研究技术与方法》分五篇，共13章，第一篇绪论包括分子生物学导论和环境样品核酸的提取；第二篇环境组学包括环境微生物基因组学、环境微生物蛋白质组学、环境微生物转录组学和环境微生物代谢组学；第三篇环境分子生物学技术包括PCR技术、分子标记技术、荧光原位杂交技术、基因差异表达研究技术、生物芯片技术；第四篇为环境分子生物学技术的应用；第五篇为现代分析仪器。