《基础藏医学史》是以藏族的历史发展为纲，以年代为线索，完整的介绍了藏医学是如何从无到有、从原始状态的医疗活动到复杂的发展状态、从低级到高级的发展进程，并且对重要的年代和突出的人物、著作做了详细的介绍。

王智森编著的《基础藏医学史》第一章主要介绍藏医学的起源，包括地理环境、藏族来历和藏医学的原始雏形等内容；第二章主要介绍藏医学的奠基，以及当时宗教、文字、吐蕃王朝等对藏医学的影响和主要的代表人物及著作；第三章主要介绍藏医学的发展，包括历史背景对藏医学的影响，以及藏医的衍承变革、突出的代表人物和著作；第四章主要介绍藏医学繁荣发展的现代时期，以及新时期各种政策对藏医的扶持和藏医学的现状。