《21世纪高等院校教材•上海市精品课程配套教材•有机化学》按照有机化合物官能团的分类原则，第一部分着重介绍烃类化合物，并介绍与之相关的基础知识、基本理论和基本概念；第二部分着重介绍烃类衍生物的结构特征和性质；第三部分介绍有机化合物结构的现代物理测定方法；第四部分主要介绍生物大分子、核酸、氨基酸、蛋白质、糖类以及萜类和甾类化合物。同时为了适应农学专业的学生需要，在介绍含氮化合物的章节中对有机磷化合物进行了适当的描述。为了拓宽学生的知识面，尽可能地与学科发展的前沿相结合，在有关章节中增加了一定量的阅读材料。
各章均有习题和思考题，书末附有提示和部分参考答案，供学生学习时参考。